5-HMSIR-COOH的化学结构与合成原理
瑞禧生物2025-08-14   作者:ws   来源:
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产品介绍:

荧光染料核心:硅罗丹明(Silicon Rhodamine, SiR),一种基于罗丹明的近红外荧光探针,通过引入硅原子替代传统罗丹明中的氧原子,明显改善光谱性能。

功能基团:

羟甲基(-CHOH):位于5位,提供化学修饰位点,可用于进一步衍生化(如连接生物分子或靶向基团)。

羧酸基团(-COOH):增强水溶性,并支持与氨基(-NH₂)通过酰胺键或酯键共价偶联,实现生物分子标记(如蛋白质、抗体或核酸)。

 

化学结构与合成原理

1. 结构特点

硅罗丹明核心:

由两个萘环通过硅桥连接,形成共轭大π键体系,赋予其近红外发射特性。

硅原子的引入降低了分子对称性,抑制了非辐射跃迁,明显提高荧光量子产率和光稳定性。

5位羟甲基:

位于萘环的5位,为亲水性基团,可参与氢键形成或化学修饰(如氧化为醛基或酯化)。

羧酸基团:

通常连接在萘环的6位或侧链,通过spacer(如乙二胺或丙二酸)与核心相连,提供负电荷,增强水溶性。

 

2. 合成方法

关键步骤:

硅罗丹明核心的构建:

起始原料:以2,7-二氯-9-(2-羧乙基)-xanthylium盐和二氯二甲基硅烷为原料。

反应条件:

溶剂:无水甲苯或二甲苯(需干燥处理)。

温度:回流(110-120°C)下反应6-12小时。

催化剂:三乙胺或吡啶(中和生成的HCl)。

产物:硅罗丹明羧酸前体(含氯取代基)。

羟甲基化修饰:

方法一:通过亲核取代反应引入羟甲基。

反应试剂:甲醇钠(NaOCH₃)和甲醛(HCHO)。

条件:室温下反应2-4小时,生成5-甲氧基硅罗丹明,随后水解得到羟甲基。

方法二:直接使用羟甲基化试剂(如氯甲基甲基醚)。

羧酸基团的引入:

侧链延伸:通过丙二酸二乙酯与硅罗丹明核心的氨基或羟基反应,水解后生成羧酸。


纯化与表征:

纯化:柱层析(硅胶,二氯甲烷/甲醇梯度洗脱)或制备型HPLCC18柱,乙腈/+0.1% TFA)。

表征:

质谱(MS):确认分子量(如m/z 650 [M+H]⁺)。

核磁共振(NMR):验证羟甲基和羧酸基团的化学位移(δ3.5-4.5 ppm-CHOH,δ12.0-13.0 ppm-COOH)。

荧光光谱:激发波长650 nm,发射波长670-700 nm(近红外区)。

 

名称:5-HMSIR-COOH

产品规格:mg/g

纯度:95%+

保存方式:-20℃以下,避光,防潮

保质期限:12个月

用途:科研
温馨提示:仅用于科研,不能用于人体

5-HMSIR-COOH

5-HMSIR-COOH 

 

西安瑞禧生物科技有限公司经营的产品种类包括有:合成磷脂、高分子聚乙二醇衍生物、嵌段共聚物、磁性纳米颗粒、纳米金及纳米金棒、近红外荧光染料、活性荧光染料、荧光标记的葡聚糖BSA和链霉亲和素、蛋白交联剂、小分子PEG衍生物、点击化学产品等等。

 

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