荧光蛋白标记：绿色荧光蛋白（GFP）及其衍生物是最常用的标记工具。通过基因工程手段，将荧光蛋白基因与目标蛋白质基因融合，使细胞表达带有荧光标签的目标蛋白。这种方法具有特异性强、对细胞生理功能影响相对较小的优点，能够实时监测蛋白质在活细胞内的动态变化，如在细胞分裂、分化过程中的定位改变等。

有机染料标记：有机荧光染料具有种类丰富、荧光性质多样的特点。可以通过化学方法将染料与蛋白质上的特定官能团（如氨基、巯基等）进行共价结合，实现蛋白质的标记。例如，一些亲脂性染料能够穿透细胞膜与细胞内的蛋白质结合，用于标记线粒体等细胞器中的蛋白质，为研究细胞器的功能和代谢过程提供帮助。

量子点标记：量子点具有光学性质，如宽激发光谱、窄发射光谱、高亮度和良好的光稳定性。通过表面修饰，量子点可以与蛋白质特异性结合，实现对蛋白质的高灵敏标记和长时间追踪。在神经科学研究中，量子点标记的神经递质相关蛋白能够清晰地显示神经信号传递过程中蛋白质的运输路径。

应用领域

细胞生物学：用于研究细胞骨架蛋白的动态组装与解聚过程，揭示细胞形态维持和运动的分子机制；观察细胞周期调控蛋白的变化，深入了解细胞增殖的调控网络。

神经科学：标记神经突触蛋白，探究突触的形成、可塑性以及神经信号传导过程中的分子事件，有助于揭示神经系统的功能和illness发生机制。

化合物研发：通过标记化合物靶点蛋白，直观地观察化合物与靶点的结合过程以及化合物对细胞内信号通路的影响，为化合物筛选和作用机制研究提供重要依据。