Cy3-alkyne是一种重要的荧光染料，分子结构中含有炔基官能团和CY3染料的结构单元。它具有较高的荧光量子产率和相对较长的荧光寿命，荧光发射峰位于约570纳米处，激发波长通常在550nm左右，在荧光显微镜下可发出明亮的橙红色荧光，且对pH不敏感。该化合物中的炔基可参与点击化学反应，特别是与叠氮基团的反应，能方便地与其他含有叠氮基的化合物或生物分子进行偶联，从而实现特定的生物标记、荧光成像等功能，在生物医学、分子生物学等科研领域应用。

稳定性：在避光、干燥、低温的条件下，Cy3-alkyne 具有较好的化学稳定性，可以储存较长时间。然而，它对光和氧气比较敏感，光照和氧气可能会导致染料的荧光强度降低，甚至发生化学结构的改变。因此，在储存和使用过程中，需要采取避光和隔绝氧气的措施。

pH 敏感性：其荧光性质可能会受到溶液 pH 值的影响。在不同的 pH 环境下，染料分子的质子化状态可能会发生变化，从而影响其共轭结构和电子云分布，导致吸收和发射光谱发生偏移，荧光强度也可能会有所改变。