Cy5.5-N3 是一种重要的荧光标记试剂。Cy5.5 属于近红外荧光染料，发射波长在 700-720 nm 之间，具有荧光量子产率高、光稳定性好等优点，能有效避免生物组织自发荧光的干扰，实现高灵敏度的检测。叠氮基团（-N3 ）则赋予了该试剂良好的反应活性，可通过点击化学与含有炔基的分子发生高效、特异性的反应。在生物医学研究中，Cy5.5-N3 可用于标记生物分子，如蛋白质、核酸等，用于细胞成像、生物分子示踪、化合物研发等领域。

光谱特性：

吸收光谱：Cy5.5-N₃ 的最大吸收波长通常在 675-695 nm 附近，处于近红外区域。这种近红外吸收特性使得它在生物成像、生物传感等领域具有重要应用，因为近红外光在生物组织中的穿透性较好，且生物组织自身的吸收和自发荧光在该区域相对较低。

发射光谱：其最大发射波长一般在 700-720 nm 左右，同样位于近红外区域，具有较高的荧光量子产率，能发出较强的荧光信号。