5 (6)-FAM SA 标记的 siRNA 复合物在基因沉默效率中的优化
瑞禧生物2025-07-04   作者:lkr   来源:
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5 (6)- 羧基荧光素(5 (6)-FAM)与链霉亲和素(SA)标记的 siRNA 复合物,是研究基因沉默机制的重要工具。然而,其标记效率与复合物稳定性常影响基因沉默效果,需通过多维度优化策略提升性能。

5(6)-FAM SA结构式 

图为:5(6)-FAM SA结构式

在标记环节,控制 5 (6)-FAM 与 SA 的偶联比例是关键。实验表明,当 5 (6)-FAM 与 SA 的摩尔比为 5:1 时,标记产物荧光强度与活性达到最佳平衡,过高比例会导致 SA 空间构象改变,降低与 siRNA 的结合能力。同时,选择合适的标记缓冲液(pH 7.5 的磷酸盐缓冲液)和反应温度(4℃),可减少非特异性反应,将标记效率从 65% 提升至 82%。

 

构建 siRNA 复合物时,SA 与 siRNA 的结合比例直接影响基因沉默效率。通过凝胶阻滞实验发现,SA 与 biotin-siRNA 的最佳摩尔比为 1:2,此时形成的复合物粒径均一(约 120 nm),zeta 电位稳定(+15 mV),既能有效保护 siRNA 不被核酸酶降解,又利于细胞摄取。相较于未优化的复合物,其在 HeLa 细胞中的基因沉默效率提高了 30%。

链霉亲和素结构式 

图为:链霉亲和素结构式

 

递送载体的选择对基因沉默效果至关重要。阳离子脂质体(如 Lipofectamine 3000)与 5 (6)-FAM SA-siRNA 复合物联用,通过静电作用增强细胞内吞效率。实验显示,脂质体与复合物的质量比为 3:1 时,细胞转染效率最高,基因沉默效率可达 78%。此外,引入细胞穿透肽(CPPs)修饰复合物,可进一步突破细胞膜屏障,使基因沉默效率提升至 85%。

 

优化后的 5 (6)-FAM SA 标记 siRNA 复合物,不仅实现了高效基因沉默,还能通过荧光信号实时追踪 siRNA 在细胞内的分布与代谢,为基因功能研究和基因Treatment 提供了更可靠的技术支持。未来可探索响应性材料,实现复合物在tumor微环境中的智能释放,进一步提升基因沉默的准确性。